Az új tervezet szerint a kormány akkor rendelhet el egészségügyi válsághelyzetet, ha:
- nemzetközi horderejű közegészségügyi-járványügyi szükséghelyzet,
- az emberek életét, testi épségét, vagy az egészségügyi ellátást veszélyeztető körülmény következik be.

Az országos tiszti főorvos figyelemmel kíséri a járványügyi helyzetet, amennyiben a válsághelyzet feltételei már nem állnak fenn, kezdeményezi az erre vonatkozó kormányrendelet visszavonását.
Az egészségügyi válsághelyzetet elrendelő kormányrendelet legfeljebb hat hónapig maradhat hatályban, kivéve ha azt a kormány meghosszabbítja. Ezt indokolt esetben teheti meg, ha a válsághelyzet elrendelésének feltételei még mindig fennállnak.
Válsághelyzetet az egész országra, vagy annak bármely területére elrendelhet a kormány, illetve működtetheti az operatív törzset.